全基因组选择or基因组选择

2025-12-20 11:27| 发布者: admin| 查看: 93| 评论: 0|原作者: Dr_Zhang

摘要: 清晰的基本概念，可以更好的理解事物并实现创新。很多人常常把Genomic selection或Genowide selection翻译成全基因组选择，而有一些人把它翻译成基因组选择（很多翻译软件或AI是这么翻译的，并被直接拿来使用）。那 ...

清晰的基本概念，可以更好的理解事物并实现创新。

很多人常常把Genomic selection或Genowide selection翻译成全基因组选择，而有一些人把它翻译成基因组选择（很多翻译软件或AI是这么翻译的，并被直接拿来使用）。那么，全基因组选择和基因组选择有什么区别呢？

首先，最早做GS育种的科学家比较倾向于使用全基因组选择这个概念，那么为什么要加一个“全”字呢？这来自于全基因组选择早期的概念——GS可以使用遍布整个基因组的全部分子标记来估计个体的育种值，而不是用少数几个标记。使用一个或少量分子标记/QTL进行育种材料选择的方案通常叫做分子标记辅助选择（Molecular marker assisted selection，MAS），也可以叫做基因组选择，因为它在筛选材料时，的确用到了基因组信息，但这种选择并不包含预测部分，且必须先对特定性状的遗传机制有清晰的认识，然后根据特殊表型对应的标记直接选择适合的材料。全基因组选择则不同，该方案必须经过建模和预测的过程。

2001年，全基因组选择的概念被提出时，为了强调GS是分子标记辅助选择但又区别于已知的MAS，把原有的MAS叫做传统的分子标记辅助选择，也就是基因组选择。同时，有学者把GS这套通工具，将多个学科与信息学和机器学习等新技术相结合来研究整个基因组（大量标记），以改进植物育种项目中的选择和交配，归类为基因组辅助育种（Genomic assisted breeding，GAB）。GAB分类下的另外两个工具分别是遗传转化和基因编辑。

因此，全基因组选择和基因组选择是两个不同的概念，但他们常常被混淆。有时，英文直译并不符合中文的使用标准。

全基因组选择和基因组选择的差异，请看图。

如果觉得思维导图太复杂，也可以查看全基因组选择和基因组选择的特征表。

特征	全基因组选择	基因组选择
标记密度	密集 (几十万到几百万个 SNP)	稀疏 (几百到几千个标记)
必须预测	是	否
预测模型	统计模型 (RR-BLUP, BayesA等)	无
已知条件	亲缘关系、系谱或无	遗传机制
应用范围	复杂性状	简单性状
成本	高	低

附录mermaid code

graph LR
A[标记辅助选择] --> B[全基因组选择]
A --> C[基因组选择]
B --> D[有预测过程]
C --> E[无需预测]
D --> F[使用大量标记]
D --> G[使用统计模型]
D --> H[适合复杂性状]
D --> I[无需了解遗传机制]
E --> J[使用一个或少数QTL]
E --> K[不需要统计模型]
E --> L[适合特定性状]
E --> M[已知遗传机制]
style A fill:#2e1065,color:white
style B fill:#f9f,stroke:#333,stroke-width:4px
style C fill:#bbf,stroke:#f66,stroke-width:2px
style D fill:#bfb,stroke:#f66,stroke-width:2px
style E fill:#fef,stroke:#333,stroke-width:2px

复制代码

路过

雷人

握手

鲜花

鸡蛋

下一篇：基因组估计育种值GEBV

		自动登录	找回密码
密码			立即注册

全基因组选择or基因组选择

相关分类